تنتشر المحطات وفق الخط الخدمات التي يمر خلالها. فبالنسبة لقطار الركاب تقيم الشركة ست محطات في كل من الرياض والمجمعة والقصيم وحائل والجوف والقريات اما بالنسبة لقطار شحن البضائع الذي يمر نفس الخط المناطق 9 محطات لنقل البضائع ست منها إلى جانب محطات الركاب وثلاث أخرى في مدينة سدير للاعمال ومدينة الأمير عبدالعزيز بن مساعد الاقتصادية في حائل ومنطقة البسيطا الزراعية أما خط المعادن فتوجد ثلاث محطات في كل من حزم الجلاميد والبعيثة إضافة إلى مدينة رأس الخير التعدينية. كما سيزداد عدد المحطات مع تنفيذ مشروع الجسر البري بين الرياضوجدة. وقد حرصت سار عند إعداد تصاميم محطات الركاب الجمع بين جمال التصميم وكفاءة التشغيل. تتكون المحطات من صالتين منفصلتين لكل من الوصول والمغادرة تم تجهيز الأولى بمنطقة لاستقبال شحن حقائب وأمتعة المسافرين والأخرى بأحزمة متحركة لاستلامها عند الوصول. كما ستحوي المحطة ساحة للمطاعم ومنطقة خدمات تضم مجموعة من المحال التجارية ومكاتب للخدمات السياحية وتأجير السيارات ومكتباً للبريد، كما يوجد بالمحطة رصيفان للركاب بمساحة 20 ألف متر مربع ومسجد. وفيما يتعلق بمحطة الرياض تم تحديد الموقع بالتنسيق مع مقام إمارة منطقة الرياض وهيئة الطيران المدني والجهات ذات العلاقة لإقامتها داخل سور مطار الملك خالد الدولي في الجهة الجنوبية الشرقية. كما يتم بناء المكتب الرئيسي للشركة المكون من ثلاثة طوابق جميع الأقسام الفنية والإدارية للشركة والمركز الرئيسي للإشارات التحكم لكامل الشبكة الحديدية. بعد اكتمال كافة الأعمال الإنشائية للمحطات والخط الحديدي بالإضافة إلى المرافق الأخرى كمراكز الإشارات والتحكم ومراكز الصيانة ستقوم سار خلال الفترة الأولى بإجراء اختبارات صحة وسلامة كامل أجزاء المشروع والتأكد من قدرتها على العمل بشكل تكاملي لضمان سلامة المسافرين وجودة الخدمات المقدمة لهم.
