صدرت موافقة خادم الحرمين الشريفين الملك عبدالله بن عبدالعزيز آل سعود _ حفظه الله _ رئيس مجلس التعليم العالي على إنشاء وكالة جامعة الحدود الشمالية للشؤون الأكاديمية والتي أقرها مجلس التعليم العالي في جلسته السادسة والستين . وأعرب مدير جامعة الحدود الشمالية د. سعيد بن عمر آل عمر عن شكره وشكر منسوبي الجامعة كافة لخادم الحرمين الشريفين _ حفظه الله _ على ماتحظى به الجامعة من دعمه الدائم غير المحدود والمتواصل لمسيرة الجامعة في أداء رسالتها وذلك تحقيقاً لأهدافها السامية مشيداً بمتابعة واهتمام وزير التعليم العالي الدكتور خالد بن محمد العنقري ، وأضاف معاليه بأن الجامعة في طريقها لاستكمال هيكلة الأكاديمية وعمادتها المساندة وستتولى وكالة الجامعة للشؤون الأكاديمية متابعة الشؤون الأكاديمية في الجامعة وبرامج المرحلة الجامعية والإشراف على أعمال القبول والتسجيل والعمادات المساندة ذات العلاقة بالشأن الأكاديمي وشؤون الطلاب وكل ماله علاقة بالمرحلة الجامعية ، بحيث تتفرع كل وكالة من وكالات الجامعة الأخرى إلى مايدخل في اختصاصها .