بدأ السودان اعتباراً من 9 تموز يوليو فترة انتقالية تستمر ست سنوات يشارك فيها متمردو الجنوب السابقون بزعامة جون قرنق الى جانب حكومة الخرطوم تطبيقاً لاتفاق السلام الموقع في التاسع من كانون الثاني يناير 2005. وفي ما يأتي أبرز المحطات منذ توقيع هذا الاتفاق: كانون الثاني يناير 2005 9 - الحكومة السودانية توقع مع"الحركة الشعبية لتحرير السودان"بزعامة قرنق في نيروبي اتفاقاً شاملاً للسلام انهى نزاعاً أوقع أكثر من مليون ونصف مليون قتيل. نص الاتفاق بصورة خاصة على تقاسم السلطة والثروة وعلى فترة انتقالية من ست سنوات يحظى خلالها الجنوب الغني بالنفط باستقلال ذاتي، على ان يقرر في ختام هذه الفترة عن طريق الاستفتاء بقاءه جزءاً من السودان او انفصاله عن الخرطوم. واستناداً الى الاتفاق نفسه فان تطبيق الشريعة الاسلامية المعمول به في الشمال يقتصر على الشمال فقط. وتصبح رومبيك العاصمة الموقتة للجنوب. 11 - دخول وقف اطلاق النار حيز التطبيق في مناطق الجنوب التي يشملها الاتفاق. 15 - الرئيس عمر حسن البشير يلتزم خلال زيارة للجنوب باطلاق مشاريع للتنمية هناك. 23 - قرنق يعلن ان وحدة السودان تتوقف على سياسة وموقف الشمال من الجنوب. 24 - المجلس الوطني لتحرير السودان برلمان الحركة الشعبية يلتئم في رومبيك ويصادق بالاجماع على اتفاق السلام. الاتفاق نفسه صادق عليه برلمان الخرطوم في 1 شباط فبراير. 25 - الاتحاد الاوروبي يعاود تعاونه مع السودان الذي كان علقه منذ 14 عاماً بسبب الحرب الاهلية. 28 -"الحركة الشعبية"تفتتح أول مكتب لها في الخرطوم. شباط فبراير 19 - البنك المركزي يعلن ان الجنيه السوداني سيكون العملة الوطنية بعد قرار مشترك بين الخرطوم والحركة الشعبية. وكان الدينار حل محل الجنيه السوداني منتصف التسعينات. اذار مارس 24 - مجلس الامن يقرر ارسال قوة من عشرة آلاف رجل الى السودان لدعم اتفاق السلام. نيسان ابريل 04 - نصف مليون نازح يعودون الى جنوب السودان منذ كانون الثاني. 11 و12 - ستون دولة مانحة تجتمع في اوسلو وتلتزم بتقديم مساعدة مالية بقيمة 4.5 بليون دولار خلال ثلاث سنوات. 19 - ميليشيات من الجنوب تقاطع مؤتمراً للمصالحة خصص لدمجها في عملية السلام. 27 - وصول طلائع قوة السلام التابعة للامم المتحدة. 30 - بدء المناقشات لصوغ الدستور الانتقالي للمرحلة الانتقالية التي نص عليها اتفاق السلام. تضم لجنة الصياغة ممثلين عن السلطة وعن الحركة الشعبية. ايار مايو 08 - أول اجتماع للجنة العسكرية المشتركة المكلفة الاشراف على وقف اطلاق النار في جنوب السودان. 29 - أول زيارة الى جنوب السودان يقوم بها الامين العام للامم المتحدة كوفي انان لدعم اتفاق السلام. حزيران يونيو 18 - الخرطوم توقع في القاهرة مع قسم كبير من"التجمع الوطني الديموقراطي"اتفاقاً للمصالحة لتعزيز اتفاق السلام في الجنوب لكن نقاطاً أساسية بقيت معلقة. تموز يوليو 03 - فشل المفاوضات بين قرنق وميليشيات تدعمها الخرطوم لوقف الهجمات على المدنيين في جنوب السودان. 06 - البرلمان يتبنى بالاجماع الدستور الانتقالي الذي ينظم العلاقات بين الجنوب والشمال في الفترة الانتقالية مع تشكيل حكومة انتقالية. 08 - عودة قرنق الى الخرطوم التي لم يزرها منذ 22 عاماً. 09 - الرئيس البشير يوقع الدستور الموقت للفترة الانتقالية ويؤدي اليمن كرئيس للجمهورية. جون قرنق يصبح النائب الاول للرئيس. 17 - اجتماع أخير للحكومة قبل تشكيل حكومة جديدة تضم شخصيات من الشمال والجنوب يفترض ان ترى النور قبل التاسع من آب اغسطس. 19 - الوضع الغذائي حرج في العديد من مناطق بحر الغزال جنوب كما أكدت منظمة"اطباء بلا حدود". 30 - مقتل قرنق في تحطم مروحيته اثناء عودته من اوغندا.