انجزت الهيئة السعودية للتخصصات الصحية برامج تدريبية مختلفة وهي تهتم بكل ما يتعلق بعملية التدريب المبرمج الموضوعي المتدرج من مستوى لآخر أعلى منه وفقاً للقدرات المهنية للمتدرب ويطبق في المستشفيات المعترف بها من قبل الهيئة وتتراوح مدته في برامج الاختصاص العامة بين 4و 6سنوات، و 2 إلى 3 سنوات في برامج الاختصاصات الدقيقة. وتهدف برامج التدريب إلى تنمية مهارات الأطباء للحصول على شهادة الاختصاصات السعودية والعربية وتطبق برامج التدريب في (44) مركزاً متقدماً (مستشفى) موزعة على جميع مناطق المملكة ويقوم بالتدريب استشاريون مؤهلون تأهيلاً عالياً. عدد المتدربين حسب الاختصاص لعام 1423ه التخصص الطب الباطني - 222.الجراحة العامة - 169.الأطفال - 283.نساء وولادة - 172.التخدير والعناية المركزة - 42 العظام - 67.المسالك البولية - 53.الطب النفسي - 50.جراحة المخ والأعصاب - 10.علاج تحفظي وإصلاح أسنان - 42.تقويم الأسنان - 5.جراحة الوجه والفكين - 5.جراحة التجميل - 7.طب الأسرة - 134.طب العيون - 85.أمراض جلدية وتناسلية - 38.جراحة الأنف والأذن والحنجرة والرأس والرقبة - 54.طب الأعصاب - 23.الأشعة التشخيصية - 71.طب الطوارئ - 16.الصيدلة السريرية - 12.طب أمراض الجهاز الهضمي والكبد - 5.القلب - 19.كلى الكبار (البالغين) - 7.العناية المركزة للاطفال - جديد.العناية المركزة لحديثي الولادة - جديد.كلى الأطفال - جديد.جراحة الأطفال - جديد. وتعتبر (شهادة الاختصاص السعودية) الأعلى في مجال التخصص وتعادل بالدكتوراه في أحد التخصصات الطبية ويتطلب الحصول عليها اجتياز الامتحان الأولي للشهادة أثناء التدريب وإكمال التدريب بنجاح في برنامج التخصص وفق المدة التي يحددها المجلس العلمي للتخصص، وكذلك اجتياز الامتحان النهائي بشقيه التحريري والسريري ويتكون الامتحان النهائي من جزئين تحريري ويشمل الجوانب الأساسية والاكلينيكية للتخصص، وسريري وشفهي يشارك فيه العديد من الأساتذة السعوديين والممتحنين الخارجين من الدول العربية، أوروبا وأمريكا الشمالية. وتعقد امتحانات شهادة الاختصاص السعودية مرة واحدة في السنة على الأقل ولا يسمح بدخولها إلا للمسجلين كمتدربين بالهيئة، وقد بلغ عدد الخريجين من عام 1997م وحتى 2001م 642خريجاً. التصنيف المهني: وقد كلفت الهيئة بتصنيف الشهادات الصحية وتقويم حامليها كما جاء ضمن مهامها وضع الأساس والمعايير لمزاولة المهن الصحية وفق (المادة: 11/2) وتبعاً لذلك فقد وضعت الهيئة القواعد العامة لتصنيف الشهادات وتقويم حامليها وشكلت لجنة دائمة لمعادلة الشهادات الصحية تضم في عضويتها استشاريين أكفاء يمثلون تخصصات الطب البشري وطب الأسنان والصيدلة والتمريض والمختبرات. وتستعين اللجنة بالعديد من اللجان الفرعية الاستشارية في كافة مناطق المملكة لتقويم حاملي الشهادات في مختلف التخصصات الصحية ولهذا الغرض تعقد الهيئة امتحانات دورية خمس مرات في العام الواحد فيما يصل إلى عشرين مركزاً امتحانياً في يوم واحد وفي أكثر من 40اختصاصاً صحياً (الطب وفروعه، الصيدلة، المختبرات، التمريض). ويهدف التصنيف المهني إلى: توثيق المؤهلات والخبرات العلمية والتأكد من مصداقيتها. التأكد من قدرة وكفاءة الممارسين الصحيين واستبعاد من يثبت عدم جدارته. تحديد الاختصاص والدرجة المهنية المناسبة لقدرات وكفاءة الممارس الصحي بما يتوافق مع الأنظمة المعمول به بالمملكة.
