نشأ الشيخ علي الحذيفي في أسرة متدينة وكان والده إمامًا وخطيبًا في الجيش السعودي تلقى تعليمه الأولي في كُتَّاب قريته، وختم القرآن الكريم على يد الشيخ محمد بن إبراهيم الحذيفي، مع حفظ بعض أجزائه، كما حفظ ودرس بعض المتون في العلوم الشرعية المختلفة. وفي عام 1381ه التحق بالمدرسة السلفية الأهلية ب محافظة بلجرشي وتخرج فيها بما يعادل المرحلة المتوسطة، ثم التحق بالمعهد العلمي في بلجرشي عام 1383ه وتخرج فيه سنة 1388ه، مكملًا للمرحلة الثانوية وواصل دراسته الجامعية بكلية الشريعة في جامعة الإمام محمد بن سعود الإسلامية بالرياض عام 1388ه وتخرج فيها عام 1392ه، وبعد تخرجه عين مدرسًا بالمعهد العلمي في محافظة بلجرشي وقام بتدريس التفسير والتوحيد والنحو والصرف والخط إلى جانب ما يقوم به من الإمامة والخطابة في جامع محافظة بلجرشي الأعلى وحصل على درجة الماجستير من جامعة الأزهر عام 1395ه، وحصل على الدكتوراة من الجامعة نفسها قسم الفقه شعبة السياسة الشرعية وكان موضوع الرسالة «طرائق الحكم المختلفة في الشريعة الإسلامية دراسة مقارنة بين المذاهب الإسلامية». وعمل الشيخ الحذيفي في الجامعة الإسلامية منذ عام 1397 ه، فدرس التوحيد والفقه في كلية الشريعة، كما درَّس في كلية الحديث وكلية الدعوة وأصول الدين، ودرس المذاهب بقسم الدراسات العليا، وقام بتدريس القراءات بكلية القرآن الكريم قسم القراءات. ويعد الشيخ علي الحذيفي أحد القراءالمتميزين في السعودية والعالم الإسلامي، وله تسجيلات إذاعية في عدد من الإذاعات داخل المملكة وخارجها، وقد أجيز في القراءات من عدد من كبار القراء وهم: الشيخ أحمد عبدالعزيز الزيات إجازة في القراءات العشر. الشيخ عامر السيد عثمان إجازة برواية حفص وقرأ عليه بالسبع ولم يكمل سورة البقرة بسبب وفاة الشيخ عامر. الشيخ عبدالفتاح القاضي قرأ عليه ختمة برواية حفص. إجازة في الحديث من الشيخ حماد الأنصاري. إلى جانب عمله بالتدريس الجامعي إمام وخطيب مسجد قباء لفترات متفاوتة إمام وخطيب للمسجد النبوي منذ 6/6/1399ه وحتى عام 1401. إمام وخطيب المسجد الحرام في مكةالمكرمة في عام 1401ه. إمام وخطيب للمسجد النبوي منذ عام 1402ه حتى الآن. رئيس اللجنة العلمية لمراجعة مصحف المدينة النبوية. عضو لجنة الإشراف على تسجيل المصاحف المرتلة بمجمع الملك فهد لطباعة المصحف الشريف. عضو الهيئة العليا لمجمع الملك فهد لطباعة المصحف الشريف. الشيخ عُين في مسجد قباء قبل عام 1398ه وبعدها عُين في المسجد النبوي 6-6-1399ه واستمر إلى شعبان 1401. 2-هذه المعلومة نقلا عن الشيخ نفسه ثم عُين في المسجد الحرام في 1-9-1401و كان إماما فقط للفروض الخمسة واستمر إلى قبيل رمضان 1402 ورجع للمسجد النبوي إمامًا وخطيبًا.
