بالرغم من مرور فترة قصيرة على تكريم مستشفى الأطفال في تطبيق معايير الجودة إلا أن عمال النظافة الرجالية يقومون بنظافة الأقسام النسائية في أوقات الصباح مما سبب إحراجاً كبيراً للمنومات مع أطفالهن حيث طالب ذوي الأطفال المنومين بالمستشفى الصحة بمنع الرجال من دخول الأقسام النسائية مستغربين في الوقت نفسه من سماح الإدارة لهم بذلك . إلى ذلك علمت مصادر مؤكدة لصحيفة الطائف أن إدارة المستشفى كلفت العمالة الرجالية بالنظافة وذلك بسبب رفض العاملات النظافة وذلك لأسباب غير معروفة .