حددت الاستراتيجية العامة للمؤسسة العامة للخطوط الحديدية التي وضعتها المؤسسة، أولوياتها بثلاث من حيث الأهمية: «أولوية عليا، أولوية متوسطة، وأولوية ثانوية». وتعد الاستراتيجية رؤية مستقبلية للمؤسسة من عام 2010 إلى عام 2040، وتشمل إستراتيجية تطوير وتوسيع شبكة الخطوط الحديدية نحو 19 خطا حديديا بطول إجمالي يبلغ تقريبا 9900 كلم. وهذه الخطوط ذات أهداف تطويرية مختلفة، يتم تنفيذها على المراحل الثلاث التالية: مرحلة التطوير الأولى (أولوية عليا): من عام 2010 حتى عام 2025 بطول تقريبي: 5500 كلم، باستثمار يبلغ نحو 63 مليار ريال. و مرحلة التطوير الثانية (أولوية متوسطة): من عام 2026حتى 2033 بطول تقريبي 3،000 كم، و باستثمار يبلغ نحو 209 مليارات ريال، ومرحلة التطوير الثالثة (أولوية ثانوية): وتمتد من عام 2034حتى 2040، بطول تقريبي 1400 كلم، باستثمار يبلغ نحو 93 مليار ريال. ويرى عدد كبير من الخبراء والمختصين أن تكون أولويات المؤسسة للفترات المقبلة مع قدوم الرئيس الجديد، الدكتور رميح الرميح، جميعها ذات أولوية عليا وذلك للحاجة الماسة التي تحتاجها المملكة في إيجاد شبكة خطوط حديدية متكاملة، تخدم التنمية الشاملة، خاصة وأن المؤسسة العامة للخطوط الحديدية توقعت أن يصل إجمالي قيمة الاستثمارات الخاصة بتطوير شبكة الخطوط الحديدية في المملكة بحلول عام 2040 إلى نحو 365 مليار ريال، موزعة على ثلاث مراحل من التنفيذ، كما أن التعجيل في تنفيذ الخطط أمر يعتبر في غاية الأهمية. وفي اتجاه إيجاد خطوط حديدية بين المدن والمناطق، وهي تحت الدراسة فقد وقعت المؤسسة عقدا مع إحدى الشركات الهندسية الاستشارية لإجراء دراسة جدوى إنشاء خطوط حديدية جديدة في المنطقة الجنوبية. وشملت الدراسة أعداد المسافرين وأحجام النقل المتوقعة على هذه الخطوط وكذلك التكاليف التقديرية. وقد قام الاستشاري بإنهاء المرحلة الأولى من الدراسة، والتي اشتملت على اقتراح عدة بدائل لمسار الخطوط موضوع الدراسة، مع الأخذ في الاعتبار المعايير التصميمية اللازمة لهذه الخطوط والميول والمنحنيات التي يجب عدم تجاوزها عند تنفيذ المشروع.
