تم تنظيم وترتيب الآثار فيه على عدة قاعات حسب التسلسل الزمني وهي على النحو التالي: 1 قاعة الفترات الانتقالية: وهي تمثل حضارة العبيد وهي منذ قرابة 5 الآف سنة قبل الميلاد وتعرض فيها بعض الادوات والمواد الاثرية التي تتزامن مع فجر السلالات في بلاد الرافدين ومواد اثرية ترجع للفترة الدلمونية بمراحلها الثلاث من 2500 سنة الى 500 سنة قبل الميلاد. 2 قاعة الفترة بين 350 سنة قبل الميلاد حتى فترة ما قبل الاسلام: وتسمى الفترة الهيلنسية والساسانية وتحتوي على بعض الاواني الفخارية المختلفة الاحجام والاشكال وبعض العملات كما يوجد مجسم لمدفن عين جاوان ويمثل احدى المقابر التي تم الكشف عنها في المنطقة وتعود للقرن الاول الميلادي. 3 قاعة المأثورات الاسلامية: وتحتوي على صور توضيحية للاماكن المقدسة في المملكة وخرائط توضح التوسع الاسلامي وانتشاره في عهد الرسول صلى الله عليه وسلم الى عهد الخلفاء الراشدين كما تحتوي على بعض الادوات الطبية ومجموعة من الاواني الفخارية التي تعود للقرن العاشر الهجري. 4 قاعة التراث الشعبي: وتتكون هذه القاعة من بعض الابواب الخشبية الاثرية وبعض ادوات الضيافة وبعض الادوات التي تستخدم في الركوب وبعض ادوات الزينة كالحلي والرشوش والقلائد والاساور كما تحتوي على بعض العملات المعدنية السعودية من عهد الملك عبدالعزيز الى عهد خادم الحرمين الشريفين كما توجد بعض الملابس والازياء الشعبية. 5 قاعة الامير محمد بن فهد: سميت هذه القاعة باسم صاحب السمو الملكي الامير محمد بن فهد امير المنطقة الشرقية لما قام به من جهود كبيرة حيث تم عرض المقتنيات الخاصة بسموه. اوقات الزيارة متحف الدمام الاقليمي : من الساعة 4 الى 10 مساء كل يوم.
