1. مشكلات في الجهاز الهضمي قد يتسبب استهلاك كمية كبيرة من بذور الشيا ببعض المشكلات في الجهاز الهضمي، لاحتوائها على الألياف بنسبة عالية، ومن هذه المشكلات نذكر: الإمساك، الإسهال، النفخة. 2. خطر الاختناق قد تتسبب بذور الشيا بزيادة خطر الاختناق في حال التصاقها في الحلق، مما يتسبب بامتصاصها للماء وهي موجودة في الحلق، مسببةً الاختناق. 3. التفاعل مع بعض الأدوية إحدى المشكلات الناتجة عن استهلاك كميات كبيرة من بذور الشيا، هي أنها قد تتفاعل مع بعض الأدوية، مثل: أدوية ضغط الدم أو أدوية السكري، مما يؤدي إلى الانخفاض الشديد للضغط أو لمستوى سكر الدم. 4. الحساسية تحتوي بذور الشيا على بعض الصفات المشتركة مع العديد من الأطعمة التي تسبب الحساسية، مثل: السمسم، والبندق، لذلك فقد تتسبب بذور الشيا بظهور أعراض الحساسية التي قد تتراوح بين البسيطة، إلى الإصابة بالصدمة التأقية (Anaphylaxis)
